6 sites Natura 2000 sur l'agglomération
Natura 2000 est un réseau européen de sites naturels protégés. Six sites ont été identifiés sur le territoire de l’agglomération pour la rareté ou la fragilité des espèces sauvages, animales ou végétales et de leurs milieux naturels. Ces sites font l’objet d’un document d’objectifs établi en concertation avec les différents acteurs du territoire qui définit les mesures nécessaires à la préservation des milieux. Cap l’Orient est opérateur pour deux d’entre eux.
Les sites identifiés Natura 2000
- « Rivière Laïta, Pointe du Talud, étangs du Loc'h et de Lannénec » : opérateur local Cap l'Orient,
- « Ile de Groix » : opérateur local Commune de Groix assistée de Cap l'Orient,
- « Rivières du Scorff et de la Sarre, Forêt de Pont Calleck » : opérateur local Syndicat du bassin du Scorff,
- « Massif dunaire Gâvres : Quiberon et zones humides associées » : opérateur local Syndicat Mixte grand site dunaire Gâvres-Quiberon,
- « Rade de Lorient » : opérateur local Cap l'Orient,
- « Chiroptère du Morbihan » : opérateur local pas encore désigné.
Quelques actions réalisées dans le cadre de Natura 2000 :
- Mise en place de suivis botaniques sur le littoral de Guidel-Ploemeur,
- Lancement d’une étude sur la loutre d’Europe,
- Travaux de maîtrise de la fréquentation sur le littoral sud de l’Île de Groix,
- Girobroyage de lande à bruyère vagabonde à Pen Men (Ile de Groix),
- Elimination des espèces invasives sur le marais de Pen Mané à Locmiquélic.
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 L'étang du Loc'h à Guidel
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